新时代农村生态治理是实施乡村振兴战略的重要议题，然而，农村生态治理在价值理念、行为主体、技术支撑、生态产业和制度体系等方面存在系统困境。要实现乡村振兴战略的顺利实施，必须突破困境，从以绿色理念引领农村生态治理，构建多元主体协同参与农村生态治理体系，加强生态技术的创新和应用，加快农村生态产业发展，健全农村生态治理制度体系五个维度实现农村生态治理理念、主体、技术、产业和制度的生态化转型，提高农村生态治理能力，尽早实现乡村全方位振兴。